ME-FA WE-FA ME-QA ME-QB ME-QC ME-QD WE-QA WE-QB MUA1 MUA2 WUA MUF1 MUF2 WUF MUB WUB ME-FB1 ME-FB2 ME-FB3 ME-FB4 WE-FB1 WE-FB2 Long1 Long2 Middle M35 M50 W50 N/G
| MUF1 - 2400m ↑205m |
| 1 | | 崎田 孝文 | 0:29:10 | | 名古屋1 |
| 2 | | 千々岩 瞳 | 0:30:53 | | 東北1 |
| 3 | | 太田康博 | 0:33:34 | | 東京1 |
| 4 | | 原田 怜 | 0:37:00 | | 静岡1 |
| 5 | | 高木 元輝 | 0:39:44 | | 東京農工1 |
| 6 | | 清水 善郎 | 0:39:46 | | 東北1 |
| 7 | | 寺村 大 | 0:40:25 | | 名古屋1 |
| 8 | | 小倉 幹弘 | 0:41:08 | | 筑波1 |
| 9 | | 千保翼 | 0:41:10 | | 金沢1 |
| 10 | | 杉本知駿 | 0:41:35 | | 立命館1 |
| 11 | | 島田 裕司 | 0:41:45 | | 東京工業1 |
| 12 | | 野田 徹 | 0:42:13 | | 東北1 |
| 13 | | 菅原大樹 | 0:42:31 | | 東京1 |
| 14 | | 片山 智史 | 0:42:59 | | 東北1 |
| 15 | | 伊藤 洋平 | 0:43:20 | | 静岡1 |
| 16 | | 大竹 彰 | 0:43:59 | | 早稲田1 |
| 17 | | 富田 康介 | 0:44:53 | | 大阪1 |
| 18 | | 石塚 脩之 | 0:45:18 | | 東北1 |
| 19 | | 纐纈 理志 | 0:45:48 | | 静岡1 |
| 20 | | 栗田 俊輔 | 0:47:22 | | 東京工業1 |
| 21 | | 山元健 | 0:47:28 | | 金沢1 |
| 22 | | 大浦 宏記 | 0:48:32 | | 京都1 |
| 23 | | 斉藤 優作 | 0:49:08 | | 新潟1 |
| 24 | | 盛合 宏太 | 0:51:41 | | 岩手1 |
| 25 | | 篠塚 高雅 | 0:52:05 | | 神戸1 |
| 26 | | 佐々木 貴浩 | 0:52:23 | | 名古屋1 |
| 27 | | 雨宮 亨 | 0:52:55 | | 千葉1 |
| 28 | | 小川 慶太朗 | 0:53:02 | | 埼玉1 |
| 29 | | 林 秀樹 | 0:55:58 | | 早稲田1 |
| 30 | | 大西 展義 | 0:56:44 | | 東北1 |
| 31 | | 開 達郎 | 0:56:51 | | 東北1 |
| 32 | | 新田 昌也 | 0:57:58 | | 山口1 |
| 33 | | 佐藤 克哉 | 0:58:28 | | 東京農工1 |
| 34 | | 杉村和彦 | 0:58:37 | | 京都橘1 |
| 35 | | 岩崎 慶士 | 1:01:27 | | 東京農工1 |
| 36 | | 伊藤 将宏 | 1:09:19 | | 東京工業1 |
| 37 | | 藤田啓明 | 1:11:05 | | 京都橘1 |
| 38 | | 松本 敦 | 1:12:04 | | 山口1 |
| 39 | | 寺川 拓 | 1:13:07 | | 静岡1 |
| 40 | | 久保義次 | 1:19:50 | | 岩手県立1 |
| 41 | | 岸裕樹 | 1:21:53 | | 名古屋1 |
| 42 | | 沓木知宏 | 1:23:22 | | 東京1 |
| 43 | | 新家 正宏 | 1:30:00 | | 静岡1 |
| 44 | | 穀野 翔 | 1:45:39 | | 中央1 |
| 45 | | 今田 和樹 | 1:48:11 | | 山口1 |
| | | 吉田祐輔 | DISQ | | 北海道1 |
| | | 佐野宏典 | DISQ | | 北海道1 |