ME WE MAL1 MAL2 MAL3 WAL MAS WAS MB WB MF1 MF2 WF MEC WEC M21A W21A M35A W35A M50A W50A M21AS W21AS M18 M21B W21B
| MF2 |
| 1 | | 高橋 元気 | 0:38:07 | | 東北大学1 |
| 2 | | 田村 陽祐 | 0:38:30 | | 筑波大学1 |
| 3 | | 角幡 原太 | 0:39:09 | | 慶應義塾大学1 |
| 4 | | 後藤 大輔 | 0:39:26 | | 東北大学1 |
| 5 | | 櫻木 伸也 | 0:39:43 | | 静岡大学1 |
| 6 | | 池 陽平 | 0:42:36 | | 北海道大学1 |
| 7 | | 川嶋 宗一郎 | 0:44:22 | | 北海道大学1 |
| 8 | | 大塚 紘史 | 0:44:35 | | 千葉大学1 |
| 9 | | 山田 祐嗣 | 0:45:55 | | 名古屋大学1 |
| 10 | | 菊池 武 | 0:47:10 | | 東京大学1 |
| 11 | | 仲村 健一 | 0:47:11 | | 京都大学1 |
| 12 | | 佐藤 崇雄 | 0:47:26 | | 静岡大学1 |
| 13 | | 北村 伸介 | 0:47:42 | | 東京工業大学1 |
| 14 | | 青木 邦俊 | 0:48:00 | | 静岡大学1 |
| 15 | | 高橋 伸寧 | 0:49:55 | | 慶應義塾大学1 |
| 16 | | 土肥 雅人 | 0:51:48 | | 金沢大学1 |
| 17 | | 後藤 俊介 | 0:52:17 | | 千葉大学1 |
| 18 | | 山口 能迪 | 0:53:26 | | 東京大学1 |
| 19 | | 永井 雄一郎 | 0:53:34 | | 慶應義塾大学1 |
| 20 | | 植村 圭祐 | 0:56:54 | | 東京大学1 |
| 21 | | 岩井 稔 | 0:57:37 | | 早稲田大学1 |
| 22 | | 小森 康孝 | 0:57:43 | | 金沢大学1 |
| 23 | | 今野 利光 | 0:57:52 | | 東京工業大学1 |
| 24 | | 鎌田 憲幸 | 1:00:21 | | 岩手大学1 |
| 25 | | 三上 諒 | 1:01:59 | | 岩手大学1 |
| 26 | | 保前 保 | 1:02:08 | | 千葉大学1 |
| 27 | | 伊藤 善人 | 1:02:12 | | 東京工業大学1 |
| 28 | | 鶴井 達也 | 1:03:29 | | 名古屋大学1 |
| 29 | | 下山 真和 | 1:04:12 | | 中央大学1 |
| 30 | | 野田 秀俊 | 1:05:12 | | 東京大学1 |
| 31 | | 水石 和秀 | 1:07:30 | | 大阪市立大学1 |
| 32 | | 石川 浩久 | 1:07:59 | | 千葉大学1 |
| 33 | | 大下 理史 | 1:08:50 | | 山口大学1 |
| 34 | | 不破 喬 | 1:10:39 | | 東京農工大学1 |
| 35 | | 山口 直哉 | 1:10:42 | | 静岡大学1 |
| 36 | | 東口 晴一 | 1:13:05 | | 東京農業大学1 |
| 37 | | 市川 祥広 | 1:14:03 | | 図書館情報大学1 |
| 38 | | 香川 譲徳 | 1:14:10 | | 東京農工大学1 |
| 39 | | 武藤 広晃 | 1:15:48 | | 名古屋大学1 |
| 39 | | 佐藤 祐樹 | 1:15:48 | | 茨城大学1 |
| 41 | | 北村 俊介 | 1:18:58 | | 東京工業大学1 |
| 42 | | 赤地 祐彦 | 1:20:20 | | 名古屋大学1 |
| 43 | | 西本 大夢 | 1:21:28 | | 大阪大学1 |
| 44 | | 室川 紘一 | 1:24:07 | | 新潟大学1 |
| 45 | | 米田 稔 | 1:24:41 | | 大阪市立大学1 |
| 46 | | 園原 揚介 | 1:27:25 | | 静岡大学1 |
| 47 | | 岡本 正光 | 1:30:00 | | 千葉大学1 |
| 48 | | 原野 剛 | 1:30:22 | | 山口大学1 |
| 49 | | 永松 敦 | 1:32:04 | | 北海道大学1 |
| 50 | | 松尾 大道 | 1:32:26 | | 山口大学1 |
| 51 | | 石角 直大 | 1:33:05 | | 京都大学1 |
| 52 | | 鶴田 翔一 | 1:33:54 | | 金沢大学1 |
| 53 | | 東條 靖 | 1:36:37 | | 静岡大学1 |
| 54 | | 水戸部 一貴 | 1:37:28 | | 電気通信大学1 |
| 55 | | 綾部 孝 | 1:39:28 | | 茨城大学1 |
| 56 | | 清塚 大輔 | 1:39:49 | | 金沢大学1 |
| 57 | | 井上 勇樹 | 1:42:53 | | 大阪市立大学1 |
| 58 | | 尾崎 友昭 | 1:51:25 | | 中央大学1 |
| 59 | | 櫻井 悠 | 1:53:00 | | 岩手大学1 |
| | | 藤田 靖 | DISQ | | 山口大学1 |
| | | 野口 喜朗 | DISQ | | 金沢大学1 |
| | | 斎藤 将孝 | DISQ | | 山口大学1 |
| | | 久野 優志 | DISQ | | 山口大学1 |
| | | 森實 剛史 | DISQ | | 東京農業大学1 |
| | | 鎌田 裕一 | DISQ | | 電気通信大学1 |
| | | 平尾 正明 | DISQ | | 電気通信大学1 |
| | | 大谷 周平 | DISQ | | 大阪市立大学1 |
| | | 福西 展之 | DISQ | | 立命館大学1 |
| | | 窪田 和博 | DISQ | | 埼玉大学1 |
| | | 新田 潤一郎 | DISQ | | 金沢大学1 |
| | | 依田 隆 | DISQ | | 千葉大学1 |
| | | 椛島 伸也 | DISQ | | 京都大学1 |