ME WE MAL1 MAL2 MAL3 WAL MAS WAS MB WB MF1 MF2 WF MEC WEC M21A W21A M35A W35A M50A W50A M21AS W21AS M18 M21B W21B
| MF1 |
| 1 | | 小林 隆昭 | 0:36:49 | | 千葉大学1 |
| 2 | | 西山 晃 | 0:40:49 | | 東京農工大学1 |
| 3 | | 西田 剛志 | 0:41:20 | | 東京大学1 |
| 4 | | 樽見 典明 | 0:42:46 | | 名古屋大学1 |
| 5 | | 今井 直樹 | 0:45:06 | | 早稲田大学1 |
| 6 | | 木平 孝和 | 0:45:13 | | 東京工業大学1 |
| 7 | | 及川 弘文 | 0:47:08 | | 岩手大学1 |
| 8 | | 村上 諒一 | 0:47:09 | | 東京工業大学1 |
| 9 | | 松井 弘之 | 0:47:43 | | 東京大学1 |
| 10 | | 高田 智実 | 0:48:38 | | 京都大学1 |
| 11 | | 市川 佑樹 | 0:48:54 | | 東北大学1 |
| 12 | | 井口 弘章 | 0:49:44 | | 東北大学1 |
| 13 | | 西山 洋生 | 0:50:38 | | 静岡大学1 |
| 14 | | 清水 陽太 | 0:50:45 | | 早稲田大学1 |
| 15 | | 渡辺 雅敏 | 0:51:24 | | 静岡大学1 |
| 16 | | 厚主 敏治 | 0:52:03 | | 図書館情報大学1 |
| 17 | | 弾塚 康平 | 0:52:10 | | 東京農工大学1 |
| 18 | | 細田 北斗 | 0:52:18 | | 岩手大学1 |
| 19 | | 石井 大生 | 0:52:56 | | 東京都立大学1 |
| 20 | | 矢崎 賢治 | 0:53:49 | | 静岡大学1 |
| 21 | | 田口 裕也 | 0:54:44 | | 茨城大学1 |
| 22 | | 京相 健二 | 0:56:00 | | 茨城大学1 |
| 23 | | 上田 達也 | 0:56:22 | | 大阪大学1 |
| 24 | | 岡 英樹 | 0:56:33 | | 東京工業大学1 |
| 25 | | 高橋 雄哉 | 0:56:43 | | 図書館情報大学1 |
| 26 | | 谷田 慎也 | 0:57:17 | | 京都大学1 |
| 27 | | 古川 康之 | 0:57:34 | | 大阪大学1 |
| 28 | | 持丸 智英 | 1:00:28 | | 千葉大学1 |
| 29 | | 村上 尭 | 1:00:54 | | 神戸大学1 |
| 30 | | 馬場 政志 | 1:01:56 | | 大阪大学1 |
| 31 | | 笹倉 拓人 | 1:01:58 | | 神戸大学1 |
| 31 | | 加藤 真基 | 1:01:58 | | 京都大学1 |
| 33 | | 干場 祐 | 1:04:07 | | 静岡大学1 |
| 34 | | 清藤 祐三 | 1:04:51 | | 国際基督教大学1 |
| 35 | | 赤木 孝信 | 1:07:55 | | 立命館大学1 |
| 36 | | 北崎 茂 | 1:07:56 | | 東京工業大学1 |
| 37 | | 八重樫 優一 | 1:09:20 | | 千葉大学1 |
| 38 | | 名木山 滋 | 1:10:06 | | 大阪市立大学1 |
| 39 | | 渡辺 徹 | 1:10:40 | | 静岡大学1 |
| 40 | | 近藤 大樹 | 1:12:06 | | 金沢大学1 |
| 41 | | 荒井 隆雄 | 1:13:26 | | 東京農工大学1 |
| 42 | | 平岡 雅芸 | 1:13:28 | | 金沢大学1 |
| 43 | | 吉川 直人 | 1:13:51 | | 電気通信大学1 |
| 44 | | 上田 篤史 | 1:14:18 | | 京都大学1 |
| 45 | | 青山 文生 | 1:14:52 | | 岩手大学1 |
| 46 | | 鎌田 健太郎 | 1:16:25 | | 新潟大学1 |
| 47 | | 真壁 浩之 | 1:16:33 | | 大阪大学1 |
| 48 | | 藤井 美岳 | 1:16:54 | | 静岡大学1 |
| 49 | | 石母田 篤 | 1:16:56 | | 茨城大学1 |
| 50 | | 海野 正英 | 1:17:14 | | 東京工業大学1 |
| 51 | | 宮川 純一 | 1:18:10 | | 筑波大学1 |
| 52 | | 猿渡 洋介 | 1:19:42 | | 京都大学1 |
| 53 | | 森 英敏 | 1:19:48 | | 静岡大学1 |
| 54 | | 下村 英雄 | 1:20:56 | | 茨城大学1 |
| 55 | | 水野 崇行 | 1:26:46 | | 千葉大学1 |
| 56 | | 鎌田 政光 | 1:28:00 | | 大東文化大学1 |
| 57 | | 下川 丈明 | 1:33:10 | | 京都大学1 |
| 58 | | 石川 潤 | 1:33:51 | | 東京大学1 |
| 59 | | 佐藤 郷 | 1:34:00 | | 筑波大学1 |
| 60 | | 阪戸 慎一 | 1:37:27 | | 金沢大学1 |
| 61 | | 西岡 英則 | 1:39:52 | | 名古屋大学1 |
| 62 | | 関 義隆 | 1:41:35 | | 国際基督教大学1 |
| 63 | | 長谷川 博之 | 1:47:47 | | 電気通信大学1 |
| 64 | | 橘 俊也 | 1:54:33 | | 電気通信大学1 |
| 65 | | 萩原 慶太 | 1:56:26 | | 神戸大学1 |
| 66 | | 長野 祐一 | 1:56:38 | | 東京大学1 |
| | | 角谷 啓延 | DISQ | | 大東文化大学1 |
| | | 松倉 淳 | DISQ | | 電気通信大学1 |
| | | 織田 勝久 | DISQ | | 中央大学1 |
| | | 伊藤 大輔 | DISQ | | 岩手大学1 |
| | | 武田 順一 | DISQ | | 電気通信大学1 |
| | | 君塚 晃平 | DISQ | | 埼玉大学1 |
| | | 近藤 崇 | DISQ | | 中央大学1 |