MS WS MO WO
| MS - 2420m ↑145m |
| 1 | | 吉田 武生 | 0:23:54 | | 京都大学 |
| 2 | | 金枝 敏克 | 0:26:22 | | 神戸大学 |
| 3 | | 小野田 剛太 | 0:28:30 | | 京都大学 |
| 4 | | 木村 洋介 | 0:28:41 | | 大阪大学 |
| 5 | | 尾島 良 | 0:29:08 | | 大阪大学 |
| 6 | | 岡本 健一 | 0:29:52 | | 京都大学 |
| 7 | | 長谷川 裕 | 0:30:41 | | 京都大学 |
| 8 | | 原 昇司 | 0:31:32 | | 大阪大学 |
| 9 | | 村上 憲一 | 0:32:07 | | 神戸大学 |
| 10 | | 仲村 健一 | 0:32:39 | | 京都大学 |
| 11 | | 長沼 佑樹 | 0:33:13 | | 京都大学 |
| 12 | | 安形 俊太郎 | 0:33:33 | | 京都大学 |
| 13 | | 守田 匡宏 | 0:33:48 | | 京都大学 |
| 14 | | 中井 隆史 | 0:33:56 | | 京都大学 |
| 14 | | 中山 敏 | 0:33:56 | | 大阪大学 |
| 16 | | 高橋 大輔 | 0:34:03 | | 神戸大学 |
| 17 | | 水越 悠文 | 0:35:07 | | 京都大学 |
| 18 | | 中川 英一 | 0:35:19 | | 京都大学 |
| 19 | | 中村 貴史 | 0:36:06 | | 大阪市立大 |
| 20 | | 赤木 孝信 | 0:36:51 | | 立命館大学 |
| 21 | | 田部 恭裕 | 0:37:27 | | 大阪大学 |
|
| 22 | | 植山 大輔 | 0:38:58 | | 京都大学 |
| 23 | | 宜保 諒 | 0:39:00 | | 大阪大学 |
| 24 | | 馬場 政志 | 0:40:36 | | 大阪大学 |
| 25 | | 萩原 慶太 | 0:42:12 | | 神戸大学 |
| 26 | | 内田 昇 | 0:42:37 | | 大阪大学 |
| 27 | | 福谷 俊行 | 0:43:08 | | 神戸大学 |
| 28 | | 山田 英雄 | 0:43:21 | | 京都大学 |
| 29 | | 高橋 誠一郎 | 0:43:25 | | 大阪市立大 |
| 29 | | 椛島 伸也 | 0:43:25 | | 京都大学 |
| 31 | | 亀田 峻宣 | 0:44:07 | | 京都大学 |
| 32 | | 櫻井 良亮 | 0:44:50 | | 大阪市立大 |
| 33 | | 上田 隆之 | 0:45:37 | | 大阪市立大 |
| 34 | | 米田 稔 | 0:47:46 | | 大阪市立大 |
| 35 | | 大西 康平 | 0:48:40 | | 京都大学 |
| 36 | | 古川 康之 | 0:49:14 | | 大阪大学 |
| 37 | | 名木山 滋 | 0:52:36 | | 大阪市立大 |
| 38 | | 市川 雄一朗 | 0:53:12 | | 大阪外国語 |
| 39 | | 上城 圭史 | 0:55:23 | | 立命館大学 |
| 40 | | 水石 和秀 | 0:57:43 | | 大阪市立大 |
| 41 | | 西本 大夢 | 0:59:58 | | 大阪大学 |
| 42 | | 渡辺 直 | 1:00:04 | | 京都大学 |
| 43 | | 佐藤 秀一 | 1:02:41 | | 神戸大学 |
| 44 | | 村上 尭 | 1:05:13 | | 神戸大学 |
| 45 | | ミホフ ローセン | 1:05:20 | | 京都大学 |
| 46 | | 五嶋 宏通 | 1:09:11 | | 京都大学 |
| 47 | | 山床 晋也 | 1:11:03 | | 立命館大学 |
| 48 | | 室田 知宏 | 1:12:12 | | 京都大学 |
| 49 | | 大谷 周平 | 1:22:32 | | 大阪市立大 |
| 50 | | 吉野 信 | 1:24:15 | | 京都大学 |
| 51 | | 三上 智 | 1:28:39 | | 神戸大学 |
| 52 | | 真壁 浩之 | 1:37:43 | | 大阪大学 |
| 53 | | 西田 圭吾 | 2:04:29 | | 京都大学 |
| 54 | | 福西 展之 | 2:05:05 | | 立命館大学 |
| 55 | | 石角 直大 | 2:19:27 | | 京都大学 |
| 56 | | 田島 佑輔 | 2:37:50 | | 大阪大学 |
| | | 杉町 大輔 | P1 | | 立命館大学 |
| | | 高橋 功次 | P1 | | 立命館大学 |
| | | 高田 智実 | P1 | | 京都大学 |
| | | 若林 孝行 | P1 | | 立命館大学 |
| | | 冨山 剛史 | P1 | | 立命館大学 |
| | | 有賀 敏典 | P1 | | 京都大学 |
| | | 吉田 智志 | P2 | | 大阪市立大 |
| | | 能勢 晃司 | P2 | | 京都大学 |
| | | 上田 篤史 | P2 | | 京都大学 |
| | | 村岡 悠 | P6 | | 大阪市立大 |
| | | 分木 優 | P7 | | 立命館大学 |
| | | 山平 拓也 | P7 | | 大阪市立大 |
| | | 堺 信夫 | DISQ | | 大阪大学 |