MUR-A MUR-B MUR-C WUR-A WUR-B WUR-C XUR-A XUR-B XUR-C MUS-A MUS-B MUS-C WUS-A WUS-B WUS-C ORA-A ORA-B ORA-C ORB-A ORB-B ORB-C OSA-A OSA-B OSA-C OSB-A OSB-B OSB-C
| MUR−C |
| 1 | | 津國 真敏 | 0:26:18 | | 京都 |
| 2 | | 田久保 豊 | 0:26:20 | | 早稲田 |
| 3 | | 纓坂 尚 | 0:26:52 | | 早稲田大学 |
| 4 | | 渡辺 裕己 | 0:27:00 | | 東京 |
| 4 | | 益本 宇一郎 | 0:27:00 | | 東京 |
| 6 | | 平岡 雅芸 | 0:27:06 | | 金沢 |
| 7 | | 羽賀 岳尋 | 0:27:13 | | 東京工業 |
| 8 | | 高橋 元気 | 0:27:21 | | 東北 |
| 9 | | 後藤 陽一 | 0:27:35 | | 東北 |
| 10 | | 室川 紘一 | 0:28:16 | | 新潟 |
| 11 | | 大杉 祥二 | 0:29:03 | | 筑波 |
| 12 | | 西田 剛志 | 0:29:06 | | 東京 |
| 13 | | 安形 俊太郎 | 0:29:07 | | 京都 |
| 14 | | 佐藤 翔太 | 0:29:13 | | 岩手 |
| 15 | | 中尾 吉男 | 0:29:20 | | 東京 |
| 16 | | 長縄 知晃 | 0:29:49 | | 東北 |
| 17 | | 古山 泰也 | 0:29:53 | | 東京 |
| 18 | | 石川 潤 | 0:30:20 | | 東京 |
| 19 | | 阿部寿洋 | 0:30:22 | | 東京理科大学 |
| 20 | | 多田野 清人 | 0:30:47 | | 筑波 |
| 21 | | 宮越 崇 | 0:30:52 | | 早稲田 |
| 22 | | 北村 伸介 | 0:30:58 | | 東京工業 |
| 23 | | 並木 政憲 | 0:31:19 | | 筑波 |
| 24 | | 能勢 晃司 | 0:31:21 | | 京都大学 |
| 25 | | 水野 崇行 | 0:31:23 | | 千葉 |
| 26 | | 石坂仁 | 0:31:35 | | 千葉 |
| 27 | | 香川 譲徳 | 0:32:25 | | 東京農工 |
| 28 | | 山田 祐嗣 | 0:32:27 | | 名古屋 |
| 29 | | 天笠 真吾 | 0:32:44 | | 金沢 |
| 30 | | 櫻井 悠 | 0:33:34 | | 岩手 |
| 31 | | 寺嶋 健太 | 0:33:38 | | 新潟 |
| 32 | | 足立 恭平 | 0:33:44 | | 慶應義塾 |
| 33 | | 佐々木 海 | 0:33:45 | | 東京工業 |
| 34 | | 稲垣孝宣 | 0:33:49 | | 京都 |
| 35 | | 井口 弘章 | 0:33:51 | | 東北 |
| 36 | | 阿部 敬寿 | 0:33:52 | | 岩手 |
| 37 | | 荒井 隆雄 | 0:33:58 | | 東京農工 |
| 38 | | 岩井 稔 | 0:34:06 | | 早稲田 |
| 39 | | 渡辺 雅敏 | 0:34:22 | | 静岡 |
| 40 | | 松井 弘之 | 0:34:26 | | 東京 |
| 41 | | 木平 孝和 | 0:34:28 | | 東京工業 |
| 42 | | 村上 巧 | 0:34:52 | | 東京工業 |
| 43 | | 那須野 勇人 | 0:34:59 | | 静岡 |
| 44 | | 本間 隆一 | 0:35:07 | | 東京工業 |
| 45 | | 竹内 瞬 | 0:35:09 | | 東北 |
| 46 | | 鷹觜 和邦 | 0:35:23 | | 東京工業 |
| 47 | | 久保田 壮一 | 0:35:26 | | 電気通信 |
| 48 | | 西尾和也 | 0:35:38 | | 京都 |
| 49 | | 京相 健二 | 0:36:02 | | 茨城 |
| 50 | | 杉山 尚徳 | 0:36:31 | | 東北 |
| 51 | | 湯沢 友豪 | 0:37:14 | | 東北 |
| 52 | | 不破 喬 | 0:38:16 | | 東京農工 |
| 53 | | 尾崎 友昭 | 0:38:35 | | 中央 |
| 54 | | 高橋 徹 | 0:38:38 | | 福島大学 |
| 55 | | 近藤 大樹 | 0:39:12 | | 金沢 |
| 56 | | 田島 佑輔 | 0:39:26 | | 大阪 |
| 57 | | 中井 隆史 | 0:39:43 | | 京都 |
| 58 | | 西郷 貴洋 | 0:39:52 | | 東京 |
| 59 | | 杉町 大輔 | 0:39:57 | | 立命館 |
| 60 | | 熊田 信次 | 0:40:01 | | 東京工業 |
| 61 | | 石角 直大 | 0:41:06 | | 京都 |
| 62 | | 朝比奈 洋直 | 0:41:29 | | 静岡 |
| 63 | | 鎌田 憲幸 | 0:41:34 | | 岩手 |
| 64 | | 佐藤 琢哉 | 0:41:55 | | 茨城 |
| 65 | | 斉 淳史 | 0:42:31 | | 図書館情報 |
| 66 | | 大塚 康紀 | 0:44:02 | | 東京農工 |
| 67 | | 景山 祐 | 0:44:14 | | 山口 |
| 68 | | 高橋 誠一郎 | 0:44:32 | | 大阪市立 |
| 69 | | 晴山 雄太 | 0:44:40 | | 東京農工 |
| 69 | | 清水 恭平 | 0:44:40 | | 新潟 |
| 71 | | 金原 慶明 | 0:44:46 | | 電気通信 |
| 72 | | 岡田 雄治 | 0:45:14 | | 名古屋 |
| 73 | | 鳥居 耕太郎 | 0:45:45 | | 慶應義塾 |
| 74 | | 池田 太志 | 0:46:26 | | 千葉 |
| 75 | | 佐藤 翔吾 | 0:47:59 | | 筑波 |
| 76 | | 前田 肇 | 0:48:02 | | 東京 |
| 77 | | 中 清行 | 0:48:12 | | 神戸 |
| 78 | | 渡辺 悠介 | 0:49:05 | | 東北 |
| 79 | | 岡野 諭 | 0:50:04 | | 東京 |
| 80 | | 赤地 祐彦 | 0:50:06 | | 名古屋 |
| 81 | | 田中 耕史 | 0:51:25 | | 東京 |
| 82 | | 渡辺 直 | 0:52:12 | | 京都 |
| 83 | | 仲田 貴幸 | 0:52:17 | | 関西大学 |
| 84 | | 若林 宗平 | 0:54:21 | | 北海道 |
| 85 | | 佐藤 秀一 | 0:56:14 | | 神戸 |
| 86 | | 四方田 雄哉 | 0:56:38 | | 静岡 |
| 87 | | 青木 大輔 | 0:57:12 | | 静岡 |
| 88 | | 高橋 大輔 | 0:57:26 | | 岩手 |
| 89 | | 須田 真介 | 0:57:50 | | 中央 |
| 90 | | 角森 哲博 | 0:58:40 | | 岩手 |
| 91 | | 佐川 雅幸 | 1:04:15 | | 茨城 |
| 92 | | 田山 恭司 | 1:06:37 | | 筑波 |
| 93 | | 佐藤 大輔 | 1:07:10 | | 静岡 |
| 94 | | 前川佳介 | 1:12:20 | | 金沢 |
| 95 | | 大谷 周平 | 1:13:13 | | 大阪市立大学 |
| 96 | | 沖 裕之 | 1:16:26 | | 東京工業 |
| 97 | | 志村 公寛 | 1:23:02 | | 慶應義塾 |
| 98 | | 渡辺 敏喜 | 1:26:57 | | 新潟 |
| 99 | | 大浅 殖央 | 1:32:11 | | 東京農工 |
| 100 | | 時田 学 | 1:34:50 | | 福島 |
| | | 嵯峨 浩靖 | DISQ | | 岩手 |
| | | 景山 健 | DISQ | | 早稲田 |
| | | 鎌田 裕一 | DISQ | | 電気通信 |
| | | 持丸 智英 | DISQ | | 千葉 |