MEQD MEQB MEQA MEQC WEQB WEQA MEFBA MEFBB MEFBC MEFBD WEFBA WEFBB MUA1 MUA2 WUA MUF1 MUB WUB MUF2 WUF MA MB WA WB N
| MUF1 |
| 1 | | 杉山 尚徳 | 0:23:47 | | 東北1 |
| 2 | | 早瀬 悠 | 0:26:08 | | 茨城1 |
| 3 | | 阿部 寿洋 | 0:28:20 | | 東京理科1 |
| 4 | | 並木 政憲 | 0:28:54 | | 筑波1 |
| 5 | | 諸江 佳樹 | 0:29:59 | | 東京1 |
| 6 | | 田中 政任 | 0:31:46 | | 東京1 |
| 7 | | 佐藤 翔太 | 0:32:57 | | 岩手1 |
| 8 | | 小松 巧実 | 0:33:43 | | 国際基督教1 |
| 9 | | 西久保 史明 | 0:34:51 | | 東京1 |
| 9 | | 舎利弗 祐介 | 0:34:51 | | 金沢1 |
| 11 | | 稲垣 孝宣 | 0:35:25 | | 京都1 |
| 12 | | 晴山 雄太 | 0:35:35 | | 東京農工1 |
| 13 | | 西尾 和也 | 0:36:01 | | 京都1 |
| 14 | | 入谷 健元 | 0:36:05 | | 京都1 |
| 15 | | 神山 康 | 0:36:41 | | 早稲田1 |
| 16 | | 吉田 知峻 | 0:37:00 | | 東京1 |
| 17 | | 國井 陽輔 | 0:39:03 | | 岩手1 |
| 18 | | 手塚 宙之 | 0:39:12 | | 慶應義塾1 |
| 19 | | 中尾 吉男 | 0:39:34 | | 東京1 |
| 20 | | 小野原 翔 | 0:39:45 | | 立命館1 |
| 21 | | 大橋 洋介 | 0:41:07 | | 慶應義塾1 |
| 22 | | 永井 成亮 | 0:41:09 | | 東北1 |
| 23 | | 中村 準一 | 0:42:45 | | 福島1 |
| 24 | | 加藤 陽介 | 0:43:44 | | 福島1 |
| 25 | | 奥田 雅彦 | 0:44:07 | | 早稲田1 |
| 26 | | 臼井 佑真 | 0:44:51 | | 静岡1 |
| 27 | | 志水 博一 | 0:47:44 | | 関西1 |
| 28 | | 虎井 達哉 | 0:49:04 | | 埼玉1 |
| 29 | | 後 洋人 | 0:51:26 | | 筑波1 |
| 30 | | 松尾 真治 | 0:53:45 | | 山口1 |
| 31 | | 高橋 大輔 | 0:54:04 | | 岩手1 |
| 32 | | 高瀬 雄大 | 0:55:48 | | 北海道1 |
| 33 | | 渡辺 聡一郎 | 0:59:35 | | 早稲田1 |
| 34 | | 月原 知行 | 1:00:28 | | 電気通信1 |
| 35 | | 山本 秀洋 | 1:00:36 | | 岩手1 |
| 36 | | 永山 貴教 | 1:05:46 | | 東京農工1 |
| 37 | | 樽見 晋平 | 1:08:44 | | 東京工業1 |
| 38 | | 南部 荘志 | 1:09:44 | | 神戸1 |
| 39 | | 高見 健司 | 1:10:56 | | 岩手1 |
| 40 | | 安達 洋太 | 1:11:06 | | 静岡1 |
| 41 | | 田山 恭司 | 1:11:36 | | 筑波1 |
| 42 | | 夢藤 健二 | 1:17:44 | | 静岡1 |
| 43 | | 石川 貴之 | 1:21:48 | | 千葉1 |
| 44 | | 時田 学 | 1:22:41 | | 福島1 |
| 45 | | 志村 公寛 | 1:26:31 | | 慶應義塾1 |
| 46 | | 工藤 琢也 | 1:27:48 | | 新潟1 |
| 47 | | 佐藤 琢哉 | 1:28:38 | | 茨城1 |
| 48 | | 渡辺 敏喜 | 1:30:08 | | 新潟1 |
| 49 | | 四十木 拓郎 | 1:58:52 | | 新潟1 |
| | | 加賀谷 暢良 | DISQ | | 岩手1 |
| | | 那須野 勇人 | DISQ | | 静岡1 |
| | | 稲田 元樹 | DISQ | | 立命館1 |
| | | 遠藤 俊幸 | DISQ | | 埼玉1 |
| | | 狭間 裕一 | DISQ | | 電気通信1 |